Na de aanslagen van 9/11 werden veel personen op verdenking van banden met terroristische organisaties door de Amerikaanse overheid opgepakt en vastgehouden, onder het mom van terreurbestrijding. Eén daarvan was Mohamedou Ould Slahi, uit Mauritanië. Veertien jaar lang werd hij zonder enige concrete aanklacht vastgehouden in het beruchte Guantanamo Bay. The Mauritanian vertelt het indringende verhaal van Mohamedou en zijn strijd voor gerechtigheid, op basis van zijn eigen memoires.
Let op: bepaalde scènes in deze film bevatten extreem geweld, waaronder marteling en seksueel geweld, en kunnen als schokkend worden ervaren.